バックアップの動作は、コピー元のフルバックアップとなります。

イメージとしては、2回目以降は、通常のHDDに全データの上書きコピーをするのと同様の動作となります。
ただし、設定時の同期タイプのチェック（増分・同期）によって、保存先側のデータ内容は異なります。

＜ご参考：バックアップ方法＞
//qa.elecom.co.jp/faq_detail.html?id=6024